Os moradores da Colônia Witmarsum têm na religião a sua principal fonte de inspiração e organização. Orientados pela Sagrada Escritura, os menonitas são aproximadamente 800 mil em todo o mundo. O líder espiritual é Menno Simons, um holandês que viveu entre 1492 e 1559. O presidente da Cooperativa Witmarsum, Sieghard Epp, explica que a religião menonista surgiu com a Reforma da Igreja, em 1500.
Na Colônia Witmarsum, existem aproximadamente mil menonistas, que pertencem ao grupo dos menonistas alemães-russos, com origem na região de Frísia, no norte da Holanda e Alemanha. Segundo Sieghard, no passado a igreja foi um refúgio e hoje funciona como uma base de apoio e orientação para os witmarsunenses. A religião tem influência significativa e bastante ativa na vida da colônia.
Para Sieghard Epp, que está em Witmarsum desde o início da colonização, a religião ajuda a formar o tripé de sustentação e desenvolvimento da colônia.
Um dos princípios básicos da doutrina menonita é o pacifismo, que resulta na recusa do dever da prestação do serviço militar, baseado no mandamento ‘‘Não Matarás’’. Os menonitas do Brasil já encaminharam vários pedidos ao governo federal solicitando a isenção do serviço militar, sem obter êxito.
Os menonistas são da opinião de que podem servir melhor ao País através de um atendimento social, como acontece com os witmarsunenses, que prestam assistência a diversas comunidades carentes em dezenas de municípios paranaenses. Em Witmarsum existem três igrejas. Em duas delas, os cultos são realizados em alemão, preservando a língua dos colonizadores.

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