Várias experiências polêmicas se seguiram a Dolly, como os ratos de cor verde fluorescente bilidade de clonar porcos para xenotransplantes (transplante de órgãos de uma espécie animal para outra), para resolver o problema mundial da escassez de órgãos.
No entanto, o assunto que mais polêmica tem gerado é o da clonagem humana. Desde o anúncio do nascimento da Dolly, o que antes parecia um argumento de ficção científica obrigou vários parlamentos a reformular a legislação e a proibir essa prática de modo específico.
No entanto, ainda há quem continue a afirmar que a clonagem humana vai ser, mais cedo ou mais tarde, uma realidade, como o cientista dissidente Severino Antinori ou a seita dos raelianos, que vêem nessa prática um modo de contornar a imortalidade.
Essa polêmica apresenta um capítulo mais delicado, o da chamada clonagem terapêutica, a clonagem de embriões para fins de investigação médica e em particular a obtenção de células-mãe, aquelas a partir das quais se pode obter qualquer órgão humano.
O fato de por cada animal clonado saudável mais de 200 tentativas fracassarem ou resultarem em malformações é mais um argumento para o debate.

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