As práticas para reduzir o desperdício de soja na hora da colheita são simples e, segundo a pesquisa, não oneram o custo de produção das lavouras. Os principais problemas detectados no campo são a má-regulagem das máquinas e velocidade incorreta do molinete (que deve ser regulado de acordo com a velocidade da máquina).
Outros fatores importantes para a diminuição das perdas são a diversificação de cultivares, através de plantios de variedades de diferentes ciclos, e a semeadura em épocas diferentes, que permitem a ampliação do período da colheita e possibilitam a utilização mais racional das máquinas e equipamentos.
O espaçamento e a população de plantas também não devem ser esquecidos, e devem permitir a boa adaptação da colheita mecânica. O espaçamento adequado diminui, inclusive, a incidência de ervas daninhas que dificultam a colheita, causando o entupimento das máquinas, retardando e onerando a operação, em virtude do tempo que o produtor gasta para colocar a máquina em condições de recomeçar a operação.
A adubação é outro fator de fundamental importância. A baixa fertilidade do solo, além de reduzir a produtividade da lavoura, pode diminuir a altura da planta e a inserção das primeiras vagens.

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