A 28ª edição do Campeonato Brasileiro começa com uma alteração no regulamento para a segunda fase de disputa. A novidade será o playoff (melhor-de-três), sistema tradicional em torneios de basquete e voleibol, que dividiu a opinião dos treinadores das equipes paulistas. Na etapa inicial da competição, porém, as regras continuam as mesmas, com 24 clubes - dois a menos que no ano passado -, lutando por oito vagas para a fase decisiva. Todos os times jogam entre si em turno único.
A série já está definida: o primeiro colocado enfrenta o oitavo; o segundo pega o sétimo; o terceiro, o sexto; e o quarto; o quinto. Para chegar à semifinal, o clube precisa marcar, pelo menos, quatro pontos nos dois primeiros jogos (uma vitória e um empate). Caso cada time vença um confronto ou haja dois empates, um terceiro jogo será marcado na casa da equipe com melhor campanha na competição. Este esquema mata-mata será utilizado até a partida final, evitando os antigos quadrangulares e deixando o torneio mais curto.
Cartões - Para a segunda fase, os cartões amarelos das partidas iniciais serão anulados e os estádios precisarão ter capacidade mínima de 25 mil lugares. Na decisão, este número subirá para 40 mil. O sistema de rebaixamento continua o mesmo, levando para a Segunda Divisão os quatro times com pior campanha na primeira fase. Para o campeonato de 2000, no entanto, os rebaixados serão conhecidos por meio da média de pontuação nas edições deste ano e de 1999. Um critério que todos concordam ser mais justo, pois assim não haverá apadrinhamentos como ocorreu com o Fluminense. As partidas serão disputadas aos domingos e em caso de terceiro jogo, 48 horas após o segundo encontro. Isso é bom, porque dá tempo de recuperar um jogador contundido.

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