Os Estados de Mato Grosso, Paraná e Roraima dão início no dia 15 de junho ao vazio sanitário, período que varia entre 60 e 90 dias sem soja no campo. De acordo com a Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa), vinculada ao Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento, essa medida visa reduzir a sobrevivência do fungo Phakopsora pachyrhizi, causador da ferrugem asiática da soja evitando assim ataques precoces da doença na safra.
Desde 2006, o vazio sanitário foi adotado no Brasil. Atualmente a medida preventiva está implantada em 12 estados (MT, GO, MS, TO, SP, MG, DF, MA, PR, BA, RO, PA). A maioria deles adotou o vazio sanitário por 90 dias.
''No Rio Grande do Sul optou-se pelo não estabelecimento do vazio sanitário, por considerarem que as condições climáticas na entressafra não permitem o desenvolvimento da soja e o Estado de Santa Catarina adotou apenas para a entressafra de 2009'', explica a pesquisadora Claudine Seixas, da Embrapa Soja,
Durante o vazio sanitário é proibido o cultivo da soja em períodos pré-estabelecidos e também é exigida a eliminação de soja voluntária ou tiguera (plantas originárias dos grãos caídos no solo durante a colheita, transporte, etc.)
Em 2011, pela primeira vez, o Paraguai adota o vazio sanitário para a soja determinado pela Resolução No. 071, de 11 de fevereiro de 2011, do Servicio Nacional de Calidad Y Sanidad Vegetal Y de Semillas (Senave). Denominado de 'pausa fitosanitaria', o cultivo de soja fica proibido entre 1º de junho e 30 de agosto, em todo o território paraguaio.

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