Além do design, o Bora também destaca-se pelos aspectos de segurança. A carroceria - com grande rigidez estrutural - foi concebida para sofrer deformação programada. Colunas, portas e soleiras têm reforços integrados e oferecem mais proteção aos ocupantes do veículo, no caso de colisões laterais. Sistema de freio a disco nas quatro rodas, cintos de segurança com pré-tensionador, imobilizador eletrônico, trava central com controle remoto e alarme anti-furto são alguns dos itens de série. O sistema ABS/EBD é de série no Confortline e opcional no 2.0.

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